El Municipio del Medio San Juán está ubicado en la Costa Pacífica Colombiana, hacia el centro sur del Departamento del Chocó, enmarcado dentro de las siguientes coordenadas geográficas 4º 31’ Latitud Norte , 76º 40’ Longitud Oeste y 5º 08’ Latitud Norte – 76º 55’ Longitud Oeste. Se caracteriza por su clima tropical húmedo, con una temperatura promedio de 28 grados centígrados. Su geografía es ligeramente quebrada sin mayores accidentes, la topografía esta bañada por las aguas de los ríos San Juan, Condoto, Opogodó y Suruco, estos últimos afluentes del primero, a lo cual se suman innumerables quebradas que complementan su inmensa riqueza hídrica. Esta entidad territorial posee una extensión de 620 Km. cuadrados, de los 44.935 Km. cuadrados del departamento; su ubicación con relación al nivel del mar es de 68 metros.
Extensión total: 620 Km2
Extensión área urbana: 95 Km2
Extensión área rural: 525 Km2
Altitud de la cabecera municipal (metros sobre el nivel del mar): 68 Mts
Temperatura media: 32ºCº C
Distancia de referencia: 75 Km de Quibdó capital del Departamento
mapas:
http://maps.google.es/maps?f=q&source=s_q&hl=es&geocode=&q=andagoya+choco+colombia&sll=5.160731,-76.684998&sspn=0.395955,0.723724&ie=UTF8&hq=&hnear=Andagoya,+Choc%C3%B3,+Colombia&ll=5.101203,-76.695557&spn=0.395992,0.723724&z=11
medio san juan cuenta con 3 cogestores sociales.
